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1、技術(shù)介紹
NGS可以獲得大量的測序數(shù)據(jù)但是由于讀長較短，無法直觀的看到整個(gè)基因組范圍的結(jié)構(gòu)變化，而且由于基因組的復(fù)雜性（重復(fù)序列和結(jié)構(gòu)變異）限制了基因組的重構(gòu)和對功能原件的理解。因此迫切需要針對更長片段的分析方法。BioNano公司利用其專利的芯片技術(shù)開發(fā)的Irys系統(tǒng)可以對長鏈DNA單分子成像，在更短時(shí)間提供更完整的基因組光學(xué)圖譜。
Irys系統(tǒng)特點(diǎn)
1. 長鏈DNA分子 — 可檢測長達(dá)幾百kb的長鏈DNA分子，很好解決重復(fù)序列和可變區(qū)對研究帶來的影響。
2. 高質(zhì)量的數(shù)據(jù) — 單分子DNA通過納米通道被拉直平行排列，利用高質(zhì)量圖像使基因組結(jié)構(gòu)展現(xiàn)無遺。
3. 應(yīng)用靈活 — 開放性的平臺(tái)適合研究人員進(jìn)行多個(gè)領(lǐng)域的研究，尤其在de novo和染色體結(jié)構(gòu)變異方面提供了全新的研究方法。
晶能優(yōu)勢
1） BioNano公司的Irys平臺(tái)，有著通量大，準(zhǔn)確性高等特點(diǎn)，在光學(xué)圖譜質(zhì)量和性價(jià)比上高于其他光學(xué)圖譜類平臺(tái)。
2） 已完成多項(xiàng)動(dòng)植物光學(xué)圖譜構(gòu)建，有著豐富的輔助NGS數(shù)據(jù)再拼接的實(shí)驗(yàn)和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)
2、技術(shù)路線
3、樣品要求
1） 樣品濃度：最低濃度40ng/μl～200ng/μl。
2） 樣品總量：每個(gè)樣品總量不少于10μg。
3） 樣品溶劑：基因組完整（大于等于150kb）、無污染。
4） 樣品運(yùn)輸：DNA低溫運(yùn)輸（4℃）；且在運(yùn)輸過程中請用parafilm將管口密封以防出現(xiàn)污染