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1、技術(shù)介紹
Infinium Global Screening Array-24 v1.0 (GSA) BeadChip是一款先進(jìn)的基因分型芯片,為群體規(guī)模的遺傳研究、變異篩查和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究提供了一種經(jīng)濟(jì)的解決方案。利用成熟的iScan?系統(tǒng)、一體化的分析軟件以及Infinium高通量篩查(HTS)分析,這款24個(gè)樣本的高密度BeadChip芯片(圖1)提供了針對(duì)廣泛應(yīng)用而優(yōu)化的內(nèi)容,并一如既往地帶來(lái)了Illumina基因分型芯片所擁有的高質(zhì)量且可重復(fù)的數(shù)據(jù)(表1)。GSA試劑盒包括BeadChip芯片和試劑的便利包裝,可利用經(jīng)過(guò)簡(jiǎn)化的高通量Infinium流程來(lái)擴(kuò)增、片段化、雜交、標(biāo)記并檢測(cè)遺傳變異。
圖1:BeadChip芯片 – BeadChip芯片基于廣受信賴的24-樣本Infinium
HTS平臺(tái)所打造。
圖1:BeadChip芯片 – BeadChip芯片基于廣受信賴的24-樣本InfiniumHTS平臺(tái)所打造。
廣泛的臨床研究應(yīng)用
BeadChip芯片上的臨床研究?jī)?nèi)容是由醫(yī)學(xué)基因組專家合作設(shè)計(jì)的,他們利用多個(gè)注釋數(shù)據(jù)庫(kù)2-5,創(chuàng)建出一個(gè)適合臨床研究應(yīng)用的信息量大且經(jīng)濟(jì)的panel(表2)。
廣泛的臨床研究應(yīng)用
BeadChip芯片上的臨床研究?jī)?nèi)容是由醫(yī)學(xué)基因組專家合作設(shè)計(jì)的,他們利用多個(gè)注釋數(shù)據(jù)庫(kù)2-5,創(chuàng)建出一個(gè)適合臨床研究應(yīng)用的信息量大且經(jīng)濟(jì)的panel(表2)。
廣泛的臨床研究應(yīng)用
BeadChip芯片上的臨床研究?jī)?nèi)容是由醫(yī)學(xué)基因組專家合作設(shè)計(jì)的,他們利用多個(gè)注釋數(shù)據(jù)庫(kù)2-5,創(chuàng)建出一個(gè)適合臨床研究應(yīng)用的信息量大且經(jīng)濟(jì)的panel(表2)。
廣泛的臨床研究應(yīng)用
BeadChip芯片上的臨床研究?jī)?nèi)容是由醫(yī)學(xué)基因組專家合作設(shè)計(jì)的,他們利用多個(gè)注釋數(shù)據(jù)庫(kù)2-5,創(chuàng)建出一個(gè)適合臨床研究應(yīng)用的信息量大且經(jīng)濟(jì)的panel(表2)。
BeadChip芯片上的臨床研究?jī)?nèi)容是由醫(yī)學(xué)基因組專家合作設(shè)計(jì)的,他們利用多個(gè)注釋數(shù)據(jù)庫(kù)2-5,創(chuàng)建出一個(gè)適合臨床研究應(yīng)用的信息量大且經(jīng)濟(jì)的panel(表2)。
3、技術(shù)路線
2、樣品要求
1) 樣品類型:細(xì)胞、新鮮組織或DNA樣品。
2) 樣品量:細(xì)胞樣品請(qǐng)?zhí)峁┲辽?span>5X106個(gè)細(xì)胞,組織樣品請(qǐng)?zhí)峁┲辽?span>100mg的組織塊或切片。DNA樣品請(qǐng)?zhí)峁?span>1μg以上的基因組DNA。
3) 樣品質(zhì)量:DNA無(wú)明顯降解,OD260/280值在1.7~1.9之間,濃度≥50n/μl。
4) 樣品保存:細(xì)胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)用液氮速凍后,-80℃保存。DNA樣品可溶于的超純水或TE(PH8.0)中,-20℃短期保存或者-80℃長(zhǎng)期保存。樣品保存期間避免反復(fù)凍融。
5) 樣品運(yùn)輸:樣品置于1.5ml管中,封口膜封好,干冰運(yùn)輸。DNA樣本放離心管或者PCR板中,密封后,冰袋運(yùn)輸。